中小板和主板上市的条件不同，交易制度不同，对投资主体的要求也不同，上市公司的市场份额也不同。
中小板流通量不足亿元，与主板市场相比较低，主板市场对发行人经营期限要求较高，份额资金规模、盈利水平等都比中小板高。中小板和主板的上市条件对主板更为严格。
从两者的交易系统来看，主板市场集合竞价采用封闭式集合竞价方式，每天只有一次开盘集合竞价。中小板市场采用公开集合竞价方式，有集合竞价开盘和收盘两种方式每天几次。
主板上市公司多为大型传统优秀公司，市场占有率高、规模大、稳定性强、盈利能力好。另一方面，中小板上市公司是相对成熟的上市公司，规模较小，市场占有率相对较低，稳定性也相对于主板较弱。
